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探索SLC43A3过表达对尤文肉瘤患者不良预后的影响
刘润泽2 , 朱永杰2 , 赵尧烨3 , 刘斌峰4 , 周强5 , 高延征1
1. 河南省人民医院
2. 河南大学人民医院
3. 郑州大学
4. 中南大学湘雅二医院
5. 新乡医学院
目的:
探索SLC43A3对尤文氏肉瘤患者生存预后的影响以及发病的潜在机制，并为尤文氏肉瘤的治疗中寻找一个有效的突破口。
方法:
第一，我们从ICGC数据库获取到了56例尤文氏肉瘤患者的RNA测序数据以及相对应的临床信息。第二，运用一系列生物信息学分析方法对尤文氏肉瘤患者预后与SLC43A3的表达水平的关系进行探索。第三，通过GO和KEGG富集分析对尤文氏肉瘤的具体发病机制进行预测。第四，利用基础实验RT-qPCR验证了SLC43A3在尤文氏肉瘤细胞与正常细胞中的表达水平。
结果:
首先，KM生存曲线和单多因素分析结果显示预测SLC43A3高表达与尤文氏肉瘤患者预后不良相关，其可作为尤文氏肉瘤患者预后的独立风险因素。随后，GO和KEGG富集分析预测可能参与尤文氏肉瘤恶性进程的生物学过程。此外，通过LINCS数据库的药物分析发现高三尖杉酯碱、依米丁、水仙碱、茴香霉素这四种小分子药物可能对尤文氏肉瘤具有潜在治疗作用。最后，RT-qPCR结果进一步证实了SLC43A3在尤文氏肉瘤细胞系中高表达。
结论:
SLC43A3作为一个致癌基因在尤文氏肉瘤中高表达，可作为一个潜在分子靶点用于预测尤文氏肉瘤患者的预后情况，其高表达可导致尤文氏肉瘤患者预后不良，并且四种小分子药物被筛选出来，可能对SLC43A3表达产生抑制作用，对尤文氏肉瘤的治疗有一定的临床参考价值。
