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弥漫大B细胞淋巴瘤中m7G RNA修饰的关键调节因子的表达特征及预后价值

王聪 , 吕烈媚 , 张玉 , 孔冉 , 王欣 , 周香香

山东省立医院

目的:

弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是最常见的非霍奇金淋巴瘤亚型,约占全部病例的30-40%,半数的DLBCL患者可通过R-CHOP显著改善预后,但肿瘤异质性和耐药性使DLBCL仍然无法治愈。研究表明,N7-甲基鸟苷(m7G)是表观遗传调控过程中发生的一种重要RNA修饰,参与多种生物过程,m7G RNA甲基化在癌症的发生和发展中起着重要作用。然而,m7G RNA甲基化调节因子在DLBCL中的表达模式和功能尚不清楚。本项目旨在探索预后标志物并构建基于m7G RNA甲基化调节因子的DLBCL的预后风险模型。


方法:

我们首先下载了具有临床信息的mRNA基因表达数据,数据集来自GEO和GTEx;差异分析研究正常组和肿瘤组中m7G因子表达差异及其相关性;一致性聚类分析对患者进行分型,并对亚型的功能和预后进行研究;通过单因素COX及LASSO回归分析构建预后风险模型,并在GEO数据集中验证了模型的有效性。


结果:

研究分析发现 CYFIP1、 LSM1、GEMIN5 和IFIT5 在DLBCL中表达水平显著上调,NUDT16、 NUDT4显著下调。随后,我们将肿瘤组分为两个亚型的共识聚类,与聚类群1相比聚类群2预后更差,且男性、高龄这两点也与预后显著相关。此外,聚类群2显著富集癌症相关的途径。基于单因素cox及lasso回归分析,我们开发了一个包含四个m7G甲基化调节因子(NUDT3,EIF4E3,LARP1,EIF4G3)的风险模型。并且根据风险评分将患者分为高风险组和低风险组,高风险组的总生存期(OS)明显低于低风险组(P<0.001)。该风险评分具有独立预后性(P=0.026),并且对1、2、3年患者生存具有良好的预测性。


结论:

我们的研究表明m7G RNA甲基化调节因子在DLBCL中的异常表达及其与临床特征的相关性。我们开发的包含四个m7G甲基化调节因子的风险模型有望为DLBCL精确预后分层提供理论依据。


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